En période estivale, les maladies qui peuvent affecter la betterave sont nombreuses, majoritairement liées à des champignons : cercosporiose, ramulariose, oïdium, rouille, mildiou, alternaria. Le virus de la jaunisse et la bactériose à Pseudomonas s'ajoutent aussi à la liste des pathogènes pouvant affecter la culture.